维恩图
维恩图(Venn),也叫温氏图、韦恩图、范氏图,用于显示元素集合重叠区域的图表。韦恩图是关系型图表,通过图形与图形之间的层叠关系,来表示集合与集合之间的相交关系。
在微生物的研究中,可根据每个样品的OTU/gene/species在每个样品的丰度,计算出每个样品或组间共有和特有的OTU/gene/species,然后绘制维恩图展示。
1
在之前的《几种维恩图的绘制方法》已经为大家分享过以下几种方式绘制维恩图:
1. 在线网址http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html
2. VennPainter软件
3. R包VennDiagram
其中,在线绘制的方法非常简单、方便。这一期,我们总结总结都有哪些在线网站可以绘制,又各自有什么特点。
一
在线绘制VENN-1
◼推荐指数:★
◼网址:
http://www.biovenn.nl/index.php
◼特点:
⏩ 2~3元
⏩ 文件上传、在线填写
⏩ 丰富的参数设置
⏩ 另存为svg、png格式结果
二
在线绘制VENN-2
◼推荐指数:★
◼ 网址:
http://www.pangloss.com/seidel/Protocols/venn4.cgi
◼ 特点:
⏩ 2~4元
⏩ 在线填写集合内容
⏩ 另存为gif格式结果
三
在线绘制VENN-3
◼推荐指数:★★
◼ 网址:
https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html
◼ 特点:
⏩ 2~4元
⏩ 在线填写集合内容
⏩ 可简单设置颜色、线条、字体
⏩ 另存为png格式结果
四
在线绘制VENN-4
◼推荐指数:★★★
◼ 网址:
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/
◼ 特点:
⏩ 2~5元
⏩ 文件上传、在线填写
⏩ 丰富的统计信息
⏩ 下载svg、png格式结果
五
在线绘制VENN-5
◼推荐指数:★★★★
◼ 网址:
http://www.interactivenn.net/
◼ 特点:
⏩ 2~6元
⏩ 文件上传、在线填写
⏩ 可设置颜色、字体大小、图片透明度
⏩ 下载svg、png格式结果
六
在线绘制VENN-6
◼推荐指数:★★★★★
◼ 网址:
http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html
◼ 特点:
⏩ 2~6元
⏩ 文件上传、在线填写
⏩ 丰富的参数设置
⏩ 下载svg、png格式结果
大家可以根据自己的数据情况,
选择合适的网站,进行绘图哟~
这一期的分享,
就到这里啦~
下期再见咯!
供稿:叶生鑫
编辑:鲁淑妮
为了避免权属纠纷,特做如下说明:本站内容作品来自用户分享及互联网,仅供参考,无法核实真实出处,并不代表本网站赞同其观点和对其真实性负责,本网站仅提供信息存储空间服务,我们致力于保护作者版权,如果发现本站有涉嫌侵权的内容,欢迎发送邮件至youxuanhao@qq.com 举报,并提供相关证据,一经查实,本站将立刻删除涉嫌侵权内容。
原文标题:在线数据可视化系列一:维恩图(维恩图)